В начале 1990-х гг., в условиях неупорядоченного финансирования, наработанный за многие годы технологический процесс помог библиотеке продолжать пополнение фондов, но в значительно меньшем объеме и со снижением качества. Почти одновременно с российского нотного рынка исчезли издания «стран народной демократии»: ГДР,ЧССР, ВНР, ПНР, СРР, БНРв послевоенный период основных поставщиков нотной продукции в СССР.
Трудное десятилетие 1990-2000 гг. отличалось вынужденной спонтанностью приобретений (ситуация изменилась лишь после 2000г.). В этот же период как бы в порядке «компенсации» от потомков многих известных музыкантов в библиотеку продолжали поступать (преимущественно в качестве даров) личные собрания музыкальных деятелей. Среди даров собрания выдающихся и широко известных музыкальных деятелей А.Д.Артоболевской, И.Ф.Бэлзы, В.П. Варунца, С.С.Григорьева, Н.С.Николаевой, И.С.Козловского, Л.И.Ройзмана, М.Н.Тэриана, Р.К.Щедрина и других. Заметным событием была покупка уникальной личной оркестровой библиотеки композитора В.Н. Васильева. Библиотеке дарили рукописи музыкальных произведений и автографы Д.Д,Щостаковича, Р.К.Щедрина, Т.Н.Хренникова, Э.В.Денисова и многих других В эти же годы в НМБТ поступили в дар многочисленные издания из разных стран. Расширились возможности контактов библиотеки Московской консерватории с другими библиотеками мира. С этого года установились профессиональные связи, которые привели к установлению более тесных взаимовыгодных контактов, что дало свои плоды в области освоения новых информационных технологий и пополнения фондов. Непосредственное знакомство с зарубежными библиотеками открыло их мир для НМБТ как мир открыл для себя НМБТ и другие библиотеки России.
В стенах старой консерваторской библиотеки на её конференциях и семинарах перебывало много ведущих специалистов из крупнейших музыкальных библиотек США, Великобритании, Германии, Франции, Швеции, Польши, Италии, Норвегии, Испании, Канады, Литвы, Украины, Белоруссии, Армении, Эстонии, Финляндии. Библиотека последовательно принимает участие в международных библиографических проектах: RILM (Международный указатель музыковедческой литературы), RISM (Международный указатель музыкальных источников), куда поставляет информацию о старопечатных изданиях и рукописях, RIPM (Международный указатель музыкальной прессы).
В 1994-1995 гг. началась автоматизация библиотеки, а к 1996 г. была создана локальная сеть АИБС "Музыка". В результате очередныхставших уже традиционнымипереездов библиотеки к 2005 г. она заняла помещения в трёх консерваторских корпусах: абонемент нотно-музыкальной литературы, отдел комплектования и учёта, отдел научной обработки фондов и каталогов, отдел компьютеризации информационно-библиографических процессов, отдел редких изданий и рукописей и дирекция библиотеки расположились в первом учебном корпусе; отдел хранения и обслуживания оркестровыми материаламив здании Большого зала (по-прежнему в подвальных помещениях); читальный зал нотно-музыкальной литературы, отдел обслуживания литературой гуманитарных областей знаний (включая художественную литературу), информационно-библиографический отдел в третьем (Рахманиновском) корпусе.
Размещение библиотеки в разных корпусах всегда затрудняло её оптимальное функционирование: организацию рационального хранения, обеспечение её безопасности и сохранности материалов, пользование фондами. Востребованность библиотеки самой консерваторией всегда была столь велика, что руководство вуза разделяло с коллективом библиотеки эту озабоченность, пыталось решать проблемы, встававшие на её пути. В настояшее время НМБТ является научно-вспомогательным и структурным подразделением Московской государственной консерватории им. П. И. Чайковского. Руководство деятельностью библиотеки осуществляет директор (с 1996 г. это Э.Б. Рассина).
Органами управления внутри библиотеки являются совет дирекции, состоящий из заведующих отделами, и научно-методический совет, куда входят ведущие специалисты библиотеки.
В наши дни библиотека Московской консерватории является:
- одним из старейших и крупнейшим музыкальным фондом страны, имеющим историческое значение;
- научной музыкальной библиотекой, которая комплектует свои фонды, предоставляя возможность пользоваться ими в учебных, научных и творческих целях и хранит их для будущих поколений;
- информационным и библиографическим центром страны по музыке, обрабатывающим текущие и ретроспективные документы в области музыкального искусства и предоставляющим информационные ресурсы пользователям как в стране, так и за рубежом; центром, осуществляющим справочно-информационное обслуживание (предоставляющим справки различного содержания, характера и назначения: библиографические, тематические, фактографические);
- учреждением, осуществляющим научно-методическое руководство библиотеками учебных музыкальных заведений страны, а также оказывающим им методическую и консультативную помощь;
- библиотекойучастницей научно-исследовательской, информационной и других видов деятельности по вопросам музыкального библиотековедения, библиографоведения и информатизации совместно с российскими и зарубежными библиотеками и центрами. Заслуга библиотеки Московской консерватории перед отечественной музыкальной культурой состоит в том, что нет ни одного русского музыкального деятеля более чем за столетнюю её историю, который не воспользовался бы её фондами.
(из книги "Библиотека Московской консерватории" Э.Б.Рассиной).